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針對我國基因組學數據“存管用”的實際需求以及“數據孤島”、“數據主權”的重大問題，國家基因組科學數據中心（以下簡稱“中心”）圍繞人、動物、植物、微生物基因組數據，重點開展數據資源及數據庫體系建設，并開展數據服務、系統運維、技術研發、數據挖掘等系列工作。該中心依托中國科學院北京基因組研究所，聯合中國科學院上海營養與健康研究所和中國科學院生物物理研究所共同建設，上級主管部門為科技部基礎司和中國科學院。中心設立管理委員會、專家委員會和用戶委員會，建立中心運行管理機制，實行主任負責制，全面負責運行和管理工作。中心組建70人左右的科學數據專業化團隊，提供基因組學數據統一存儲、整合挖掘、共享應用的一站式數據服務，成為有國際影響力的基因組科學數據中心。